至90年代中期，尋求克服ERP缺點的努力開始有了成果，這就是高級計劃與排產技術（Advanced Planning and Scheduling，APS）的實用化和供應鏈管理（Supply Chain Management，SCM）、客戶關系管理（Customer Relationship Management，CRM）以及后來的電子采購e-Procurement、電子貿易e-Exchange等等。
BoB應用軟件系統
人們將這些經過長時期精心培育、發展而推出的、在某一功能領域內集成的，既在某一個方面有優于ERP的特長，又有很強的獨立性的軟件稱為：“Best-of-Breed（BoB）”應用軟件。
APS、SCM、CRM等新型軟件系統的共同特征是：
- 面向制造過程的某個單一的領域，具有更豐富的事物處理功能
- 基于價值流、協同商務或精益制造的管理理念
- 采用現代通訊和Web的數據交換平臺
- 具有完備的決策分析手段和能力
90年代中期，世界企業應用軟件界借用了一個名詞“Best of Breed+ ”用來描述新涌現的、具有上述特征的軟件系統。人們將這些經過長時期精心培育、發展而推出的、在某一功能領域內集成的，既在某一個方面有優于ERP的特長，又有很強的獨立性的軟件稱為：“Best-of-Breed（BoB）”應用軟件，我們不妨稱其為“單項優勢”軟件系統。更概括的可以表達為：
單項優勢軟件（BoB）=OLTP + Web + DSS + Collaborative Commerce
在各種BoB軟件系統中，根據其應用領域，采用的決策分析DSS方法和模型各有不同，如：
單項優勢軟件（BoB）=OLTP + Web + DSS + Collaborative Commerce
在各種BoB軟件系統中，根據其應用領域，采用的決策分析DSS方法和模型各有不同，如：
- SCM――為線性規劃、混合整數規劃、運籌學OR、高級計劃排程APS等
- CRM――為預測、統計學和數據倉庫DW、聯機分析處理OLAP、數據挖掘Data Mining 等
- e-Procurement、e-Exchange――需要綜合APS、OLAP技術。
BoB與ERP功能的重疊
無論是SCM或CRM，其基本功能與ERP系統中的對應子系統的功能在相當程度上是重合的、甚至是包容的，但也有差異。客戶關系管理CRM是管理和記錄商家或廠家與客戶所有的接觸活動，分析所獲取的數據，達到更有效地擴大目標市場，使企業充分利用客戶資源、決策產品和銷售的渠道，發現新的贏利增長點的新手段。客戶關系管理由兩大子集構成：作業處理和分析處理。作業型CRM（OCRM）的自動化銷售、自動化營銷和自動化客戶服務涵蓋了ERP中的訂單處理、發貨處理、預測、ATP、分銷商及用戶的管理。具有特色的是基于Web和其它現代通訊手段的新的應用，如Call center等，與ERP同時發展，功能也有重疊。CRM對傳統ERP的銷售和分銷系統，在技術上和對用戶作用上的本質突破，是對銷售和客戶活動的分析處理，應用CRM不能缺少OLAP功能。
BoB與ERP的集成
從APS 或CRM的應用出發，目前許多系統畢竟不夠大，信息也少，很難獨立支持完成某項計算。企業現有其它系統的數據也不夠完整，因此BoB軟件與ERP的集成往往是迫不得已的。
BoB軟件與ERP的集成往往是迫不得已的，如在APS中的可供定貨量的計算，就必須與工作定單管理、庫存、BOM、工藝路線和采購系統相連接；APS進行計劃模擬時，必須與ERP的車間管理、能力數據做實時的交互，單獨使用APS很麻煩和不完善，最終會導致系統崩潰。應用CRM也絕少不了原有ERP系統的主生產計劃、庫存管理等提供統一的數據。從ERP的立場出發，與APS、SCM或CRM的集成，就是裝備了APS、ATP引擎，可以解決MRP的固有缺陷。這些想法是很自然的，但必須解決很多難題。
因為兩種系統的設計源于不同哲理，APS直接使用ERP的數據，是根本不可能的。有人形容這些措施如同人的心臟移植手術。計劃模塊MPS和MRP是ERP的心臟，心臟移植會引起“排異反應”。APS進入ERP系統也會引發信息系統的心臟病發作。在將ERP與APS集成時，必須仔細地進行對照數據結構的原始定義，對ERP的數據結構做小心的更改。
盡管存在問題，無論是ERP供應商或者是APS供應商，大家還是這樣做了。ERP的供應商都采用各自的策略在自己的產品中加入APS功能。如：或自行開發APS模塊、或并購1個或多個APS供應商，將他們的產品改造裝入ERP套件中；或與一個獨立的APS供應商形成聯盟關系，將其APS產品裝入到ERP套件中來，等等。
ERP供應商建立自己的APS模塊，形成APS與ERP的無縫集成是最好的方案。但是只有少數ERP供應商能夠采取這種策略。主要因為這種開發既需要大量的投資又消耗時間。若干資料提到，開發APS系統需要有數學或運籌學的專門人才歷經5年左右的時間。在時間就是金錢的競爭環境中，這幾乎是不可能的途徑。近兩年來，幾乎每個外國的ERP軟件，無論是買的還是自己開發的，80%有了與之集成的APS引擎。如SAP 有了 SAP APO (Advanced Planning and Optimization), Baan 有BaanSCS (Supply Chain Solutions), Oracle 買了ILOG的產品, PeopleSoft 購買了Red Pepper，而JD Edwards 則買了Numetrix。最近專門供應航空和國防工業ERP軟件的Western Data Systems (WDS)公司與Adexa, Inc結成聯盟為航空工業企業和MRO提供SCM的集成解決方案。ERP和APS正在融合在一起。ERP與CRM的集成也有類似的情況。
盡管理論上說APS、SCM也包括了CRM軟件，都能獨立運行發揮作用，但真正產生效用，還必須有ERP的支持，ERP還是e-business 和e-commerce的基礎。有專家說：建樓房不能從第二層開始。在這場IT經濟革命交響樂中，沒有ERP，就不能奏響CRM或SCM的第二樂章、第三樂章，也就不會有再后續的e-business成功的新高潮。
ERP定義的變化
SCM、CRM等一批“單項優勢”軟件的出現，使ERP的定義正在悄悄地變化。近一二年來，很多文獻上已經將ERP系統定義為制造企業事物處理的中樞（transaction backbone）。
ERP系統此定義將企業的各種業務功能（如人力資源、財務、制造、會計、分銷等等）鏈接到一個共同的系統中，使企業業務流程流暢和事務處理工作自動化。這種定位實際在強調ERP的集成和作為數據源的作用，ERP更趨向于扮演應用軟件集成框架的角色。具體的核心業務作業（不僅僅是事物處理，新的業務作業在很大程度上并行著優化決策的功能），由SCM、CRM、e-Procurement、 e-Exchange等軟件來完成。
對All in One的新挑戰
集成、單一數據源是ERP對企業應用的最重要的貢獻。但在新的經濟型式下，對ERP的集成性能除了數據和流程的集成以外，作為若干BoB系統的集成框架，則必須有更靈活方便的要求。
ERP的集成性能在靈活方面有如下要求：
- 在已經實施了ERP的企業中，需要在ERP集成框架之內加入新的SCM或CRM應用
- 某些企業對ERP套件中的某些功能有特殊的要求，而ERP又不能滿足需求時，企業希望用中意的BoB軟件配置自己的“ERP”系統
- 在網絡經濟時代，虛擬企業的發展和企業頻繁的并購重組，常常會遇到企業分部并入或賣出的情況。ERP的基本結構就必須適應快速變化的需求，迅速地將原來的應用集成到統一系統中或者將其拆離出去。由于這種公司重組的情況越來越多，企業需要各種原先不曾料到的不同應用的即插即用式的集成
- 現在的公司沒有時間去構建或實施一個統一、龐大的集成信息系統的基礎構造。為保持各方面的競爭優勢，當前的企業需要集成若干“單項優勢軟件”來支持它的業務實踐
- 應用企業始終對實施統一ERP的曠日持久的過程表示不滿，保護原有系統的資源也是從未間斷的議題。
著名的Dell Computer公司于1994年就采用了SAP的R/3軟件管理計算機的制造作業。由于計算機生產模式的變化，對SAP軟件進行了兩年的客戶化工作，終于因為龐大的系統難以應付急劇變化的市場環境，Dell還是放棄了統一ERP套件的應用，在新的計劃中僅僅保留了SAP的人力資源軟件。Dell新的ERP戰略是基于Best-of-Breed 的，從不同軟件包中選擇最合用的功能替代統一的套件產品。即選擇供應鏈管理供應商 i2 Technologies的物流管理、選擇Oracle的定單管理、Glovia公司的庫存控制、倉庫管理和物料管理。Dell公司在本土、愛爾蘭和馬來西亞的3000多雇員中運行這樣的系統。Dell的戰略提出了按企業“量身定制” ERP或“make-to-order” ERP的需求。
基于Best of Breed的組合型ERP只有通過“集成軟件”才能達到。集成軟件是“中間件”的新一代產品，能夠提供即插即用(plug-and-play)、靈活可靠、幫助用戶提升現有軟件系統能力。這些集成軟件正在成為以獨立的應用軟件來構建信息技術基礎以支持業務創新的關鍵。已經有許多能夠提供集成軟件和為企業構建組合的ERP系統的公司：WebMethods、Frontec、 Vitria和 Oberon等。隨著集成軟件的完善，以一個ERP為框架，集成Best-of-Breed 軟件的組合式ERP系統會得到更多的應用。但是，有特殊需求必須采用Best-of-Breed集成方案的企業也不過占20%，也就是80%的企業還是選用ERP套件為上策。
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